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25th
Feb 2016
Mohamad Awada
@momozaza
Feb 25 2016 03:22
J'avais quelque question , je pense je vais les laisser pour la prochaine rencontre la semaine prochaine
David Lauzon
@davidonlaptop
Feb 25 2016 04:58
ok
David Lauzon
@davidonlaptop
Feb 25 2016 19:11
@momozaza : est-ce que tu peux essayer de mettre en relation ton travail sur les format de fichiers plink ch11,19 avec la BD OptiTheraHits des bio-informaticiens ?
j’ai ajouté tous les champs de OptitheraHits dans le document de mapping avec ADAM
C’est l’onglet GWAS
David Lauzon
@davidonlaptop
Feb 25 2016 19:17
Les bio-informaticiens pensent que cette OptitheraHits représente un modèle générique qui permet de stocker tous les résultats GWAS. J’aimerais qu’on valide cette hypothèse
David Lauzon
@davidonlaptop
Feb 25 2016 19:38
Il faudrait voir si on peut fitter les champs que tu as répertorié dans cette BD, et suggérer des changements au besoin.
La majeure partie devrait fitter dans la table assoc
J’ai fait un exemple voir ligne 48
on commencer par les fichiers plus urgent: .ASSOC.LINEAR, .ASSOC.LOGISTIC, et .ASSOC